南红玛瑙保养，要注意避开热源，如阳光、炉灶等，因为玛瑙遇热会膨胀，分子体积增大影响玉质，持续接触高温，还会导致玛瑙发生爆裂。
南红玛瑙要保持适宜的湿度，尤其是水胆玛瑙在形成时期里面就存有天然水，如果当前周环境很干燥，就会引起里面天然水分的蒸发，从而失去其收藏的艺术和经济价值。
一般佩戴南红玛瑙后一至三月就要净化清洗一次，即便开过光的也要定时清洗。南红玛瑙长时间佩戴或摆放的话表面会产生油污或灰尘。要用柔软的毛刷清洁灰尘;应以温淡的肥皂水刷洗油污，最后用清水冲洗干净。
2要避免硬物与南红玛瑙碰撞。南红玛瑙的硬度较大，故受到撞击也容易破碎，尤其镂空的南红玛瑙则更容易损坏。平常要把它摆放在稳固结实的地方，或者摆放在质地柔软的盒内。
人们会把长期佩戴玉器饰品之类的过程叫做“盘”，并且认为“盘”的越久越有灵性。随之而来的一种现象便是：南红玛瑙“盘”久了饰品的颜色会加深，颜色会更加的油润、有光泽度。
南红玛瑙手串是天然产物，存在一定的内部结构。像在冬季与夏季，要十分注意南红玛瑙手串的水分保养问题。因为冬季，太过干燥，而夏季，太过炎热，这两个季节都会令南红玛瑙手串的水分丧失，所以为了保持南红玛瑙手串原本的光鲜亮丽，最好是将其保存于有一定水分的环境中。
