碧玉翡翠的区别主要表现在颜色、表面的光泽度、内部结构，细腻程度等方面。碧玉颜色呈鲜绿-碧绿-暗绿色，玉石中常常含有黑点等特征，碧玉以色青绿-鲜绿者为贵，有黑色杂质、色淡的次之。翡翠的颜色多不均匀，常有颜色浓淡、深浅的颜色变化，行业内称为色根。翡翠绿色主要是由铬离子和二价铁离子造成的，铬离子致色的翡翠呈现翠绿色，颜色很鲜艳。
碧玉抛光面呈油脂光泽，微透至半透明，质地坚韧。翡翠有玻璃光泽，光泽感呈现的力度是由内向外层次渐强的光泽感。肉眼观察翡翠的光泽强一些，明显较亮。
翡翠中常见的金属矿物杂质常见的是铬铁矿，肉眼观察围绕暗色的金属矿物。矿物发生分带现象，中心的金属矿物是黑色的，向外是绿色的矿物而且绿色渐浅。在碧玉中黑色的金属矿物周围，绿色矿物没有颜色的变化。
碧玉的结构通常比翡翠更加细腻，油脂光泽强。透闪石的纤维更加细小。简单的放大观察极难看到透闪石的纤维，只有在玉石的风化面上，或抛光比较差的玉器表面才能看到透闪石的晶体。翡翠常见的是纤维交织结构，优质翡翠的结构很细腻，而一些普通翡翠呈粒状变晶结构，柱状变晶结构，这样的翡翠由于硬玉晶体比较大，常见苍蝇翅。所以，有人说的“苍蝇翅”是翡翠的鉴定的唯一标志。
另外，在翡翠雕件或者摆件的表面，特别是抛光差或者根本就没有抛光的部位很容易见到“苍蝇翅”的，这一点是要多注意的。
