南红玛瑙易与烧色玛瑙混淆，烧色玛瑙并不是假冒的玛瑙，也属于天然玛瑙的一种，只不过是在原有的基础上进行了优化加工。它与南红有一定的相似性，要注意将两者区别。
红色金丝玉还是比较少的，优质金丝玉有着一种宝石光，通透性也与南红玛瑙相似，多为微透或半透。金丝玉的内部有着特殊的条纹，但是与玛瑙纹不同，其条纹仅存在于内部，就像切开的萝卜一样，分布着萝卜纹理一样的线条，因此被叫做萝卜纹。
红碧玉就是常用来冒充南红的一种低档玉石。两者从外观上很相似，但是南红价值要高很多。虽然从外观上，红碧石的外层带有褐色至铁黑色的皮壳，就像南红玛瑙一样。红碧玉石颜色以红色为主，间有黑色斑点杂质;块度大小不等，小的如豆粒，而大的则重达几十公斤。
南红玛瑙质地温润，表面给人一种胶质状，与鸡血石和玉石都是不相同的，后者光泽感比较强，玉石颜色光鲜亮丽，没有玛瑙的润泽。品级高的南红不仅柔和润泽、有水分，而且具有一定的透明度，边缘处泛着淡淡的光晕。南红玛瑙最大的价值在于其颜色，柿子红、南瓜红、玫瑰红、正红也称为棉红色都是非常不错的，价值最高的玛瑙为正红色。
