天然玛瑙颜色鲜艳亮丽,自然而成,过渡自然,层次分明。而染色玛瑙颜色浓艳,自成一体,过于均匀,且没有层次感,颜色过渡之间界限也不分明。
天然玛瑙纹理自然流畅,界限锐利清晰;而染色玛瑙经过加热上色,界限模糊,看起来并不是十分清楚。
天然玛瑙硬度高,不易受损,染色玛瑙硬度稍低,容易出现刮痕;而且,天然玛瑙重量也比染色玛瑙重,且内部有瑕疵、包裹体。
天然玛瑙内部有杂质和包裹体,混沌不清晰,透明度不高;而染色玛瑙经过处理,内部杂质减少,透明度高。
天然玛瑙结构紧密,敲击会有清脆的响声;而染色玛瑙内部结构被破坏,敲击声音沉闷,没有质感。天然玛瑙表面有瑕疵,而染色玛瑙在十倍放大镜下却有不均匀的色点。