在南红玛瑙收藏里，珠子可以算硬通货。一是南红大料少，特别是保山南红还有天然多裂的特性，大部分合适做成小珠小挂件、手串等;二来珠子不像雕件有对题材的好恶、雕工的高低评判的比重大，算得上是非常受大众青睐的样式，不同收入阶层的爱好者都可以选购到自己喜欢的南红。所以珠子类在南红市场中也是销量最大的。
但是业内对于南红珠子的等级没有明确分类，好的南红珠子与差的珠子之间价格差距也很大。
首先，价值最高极品珠子应该是：无矿、无裂、无水晶、无杂质，自然光源下颜色一致，无其他混色或纹理，但南红是自然资源，纹理本是自然规律，没有纹理的的珠子可以说是万里挑一的。
一般满色满肉、老南红珠子可以达到此水准，特别是老南红玛瑙珠子的包浆，会随着年份的推移和把玩时间的累积，而愈发厚重和富有光泽。但这种光泽不刺眼，是由内而外焕发出的，有一种淡雅朦胧的感觉。整体审美艺术价值颇高，价值不菲。
现今资源稀缺、开采困难、开采限制等原因，南红原石出产大大减少。好一点的料子也早就被选走，极品珠子现在出产量越来越少，可遇而不可求。
其次，除南红珠子大可以从以下几个方面进行评判，分级。
一级，一级品质的珠子是基本色相一致且色泽均匀，透光性比较好。与顶级珠子相比有些微可见自然纹理。常见为柿子红，或是均匀的混入少量玫瑰红，两种颜色雾状结合，均匀色的缠丝结构，少量的石筋等，这些都是一级南红珠子的最低标准。
二级，此类珠子相对前两者量大很多，所以市场价格中等，无矿无裂无水晶有明显的纹或玫瑰红色，和一级品价格相差2到3倍。
作品呈半透全红、微结构全红状，玫瑰红全红半投料就属于二级。除此之外，允许有少量的白缠丝，少量的透明料以及水缠丝。
三级，自然就是比较差一点的了，带有少量细微矿点且有无法被自身纹理掩饰的料子归于四级，这种珠子最大的优点就是价格相对低一些，可以当做入门级南红。
当然，除了这几种分类外，还有几种珠子独树一帜：
火焰纹珠子，即柿子红与玫瑰红交织而呈的一种成色。精品南红火焰纹珠子，火焰纹理自然流畅，火焰栩栩如生，向上涌动着，似要跃然而出。
冰飘，即冰地飘红。冰地清澈透明，给人一种晶莹如冰的感觉;飘红则是指在冰底上飘着些许红色。精品冰飘手串，价格涨幅甚至有超过了纯色南红。漂亮的冰飘珠子，品相美观富有艺术性，每一颗都如同一幅画。
