玛瑙的色彩非常丰富,常带有不同颜色的层状和圆形条纹环带，自然色主要是红色、琥珀色和白色，以红色为佳。而市场上出现的一些红、黑、黄、绿、蓝、紫等色，有些是由灰色、浅色等色彩不太美丽的原料经过加工之后人为染成的。
颜色：真玛瑙色泽鲜明光亮，假玛瑙的色和光均差一些，两者对比较为明显。天然红玛瑙颜色分明，条带十分明显，仔细观察，在红色条带处可见密集排列的细小红色斑点。用石料仿制的假玛瑙，烟壶多数在底部呈花瓣形花纹，络成“菊花底”。而染色蓝玛瑙颜色艳丽、均一，给人一种假的感觉。
质地：假玛瑙多为石料仿制，与真玛瑙比质地较软，用玉在假玛瑙上可划出痕迹，而真品则划不出。从表面上看，真玛瑙少有瑕疵，假玛瑙则较多。
工艺质量。质优的玛瑙生产工艺严格且先进，故表面光亮度好，镶嵌牢固、周正，无划痕、裂纹。
级别：水胆玛瑙是玛瑙中最为珍贵的品种，特征是玛瑙中有封闭的空洞，其中含有水。
透明度：真玛瑙透明度不如人工合成的好，稍有混沌，有的可看见自然水线或“云彩”，而人工合成的玛瑙透明度好，象玻璃球一样透明。
重量：真玛瑙首饰比人工合成的玛瑙首饰重一些。
温度：真玛瑙冬暖夏凉，而人工合玛瑙随外界温度而变化，天热它也变热，天凉它也变凉。
